کوی دانش - kooy

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند
29 اردیبهشت
09:45 1395
تصویر فوق: هانک باس استادیار دانشگاه، تکنیکی ژنتیکی را نشان می دهد که وی و دانیل ورا پیشگام استفاده از آن در دانشگاه ایالت فلوریدا بوده اند. محققان FSU و دانشگاه کورنل با استفاده از تکنیک نقشه برداری ژنتیکی که توسعه داده شده است، نشان دادند درصد کوچکی از کل ژنوم ذرت مسئول تمام تنوع صفات این گیاه می باشد. هانک باس، استادیار علوم زیست شناسی در FSU، و دانیلا ورا مدیر یک مرکز پزشکی و ژنومیک FSU از دانش فنی خود در زمینه نقشه برداری از ژنوم ذرت استفاده کرده و آنرا با دانش فنی ژنومیک های آماری همکاران دیگر در دانشگاه کورنل به نام های الی راجرز ملنیک و اد باکلر ترکیب نموده و دریافتند بخش کوچکی از کروماتیک، همان کمپلکس DNA و پروتئین های مربوطه به آن، مسئول 40 درصد از تنوع ارثی صفات ذرت می باشد.


به این ترتیب بخش کوچکی از کروماتین مسئول بخش بزرگی از اطلاعاتی است که ویژگی هایی نظیر اندازه گیاه، شکل، واکنش به استرس و حاصل آنرا مشخص می کند. 
باس ادامه می دهد: "آنچه که در ضمن انجام مطالعه یاد شده باعث تعجب من شد این بود که تکنیک پروفایل بندی کروماتین در نقشه برداری از بخش مهم کاربردی ژنوم ذرت تا چه اندازه موثر می باشد."
تحقیق مزبور در نسخه 16 ماه می ژورنال Proceedings of the National Academy of Sciences منتشر شده است.  
شناسایی این بخش از ژنوم باعث می شود تا حوزه ای که به منظور رشد ذرت و ادیت ژنومیک بررسی می شود بسیار کوچک شود، که همین می تواند سرعت بهبود محصولات کشاورزی را تا حد زیادی ارتقا دهد. بدین ترتیب افرادی که بکار پرورش ذرت می پردازند می توانند نواحی ژنومی را که در توسعه محصولاتی مقاوم تر در برابر خشکسالی یا بادوام در زیست محیط های صعب نقش دارد، به سرعت هدفگیری نمایند. 
باکلر می گوید: "نتیجه آنست که می توانیم تغییرات جفتی تک پایه (جهش های کوچک) تنظیم کننده و یا آنهایی را که به گیاهان امکان تطابق با زیست محیطشان را می دهد هدفگیری نماییم. یعنی می توانیم تلاش های خود را به صورت بسیار تخصصی تر ادامه بدهیم."
ذرت به عنوان «گونه مدل» در تحقیقات علمی شناخته می شود، زیرا تنوع ژنتیکی و منابع استثنایی داشته و دهه ها تحقیق راهگشا در زمینه مکانیسم های وراثتی را تضمین می کند.
 این مطالعه جدید در تشریح نحوه بیان داشتن ژن های مختلف از سوی گیاهان  که در انواع سلولی مختلف صورت می گیرد کمک می کند، لازم به ذکر است که به این منظور DNA بایستی به اندازه تقریبا 1 میلیونیوم طول خود فشرده شود تا داخل هسته سلولی جای بگیرد. حتی در صورت فشرده شدن نیز، باز مناطقی به نام «کروماتینِ باز» وجود دارد که الگوهای پیچیده تنظیم ژنی را هماهنگ می سازد. محققان می خواستند ببینند در فضای «کروماتین باز» چه اتفاقی می افتد. 
مطالعه مزبور نشان دهنده اولین مورد استفاده از تکنیک پروفایل بندی کروماتین است که ورا و باس به عنوان بخشی از پروژه ای که هزینه آن توسط NSF تامین شده، در دانشگاه دولتی فلوریدا توسعه دادند. به این منظور محققان دانشگاه کورنل 600 هسته را به FSU فرستادند تا ورا و باس آنها را کشت کرده و به نهال بدل شد، بافت را از ریشه ها، ساقه و برگ ها جمع آوری نمودند و سپس هسته سلول را جداسازی نمودند. هسته در معرض آنزیمی قرار گرفت که بخش های خاصی از DNA را می بُرد و داده ها به صورت محاسباتی و آماری تحلیل شدند تا بتوان کروماتین باز را در ژنوم شناسایی نمود.
 به گفته باس: "مثل پیدا کردن کلید برق روی دیوار می ماند. پروفایل بندی کروماتین نشان می دهد که کدام بخش از ژنوم، نقش کلید برق ژنتیکی را به عهده دارد."

کلمات کلیدی

اشتراک

درباره نویسنده

هنگامه خوش خلق

هنگامه خوش خلق

اینجانب فعالیت خود را به عنوان مترجم از سال 88 و با همکاری با انتشارات طاهریان آغاز کردم .و سپس به عنوان کارمند مترجم با شرکت های مختلفی همکاری داشته ام . در این میان لازم به ذکر است که فعالیت های اینجانب علاوه بر ترجمه کتاب (در آخرین مورد نشر آوند دانش)شامل ترجمه مقالات ، همکاری به عنوان مترجم شفاهی در دوره ها و سمینارهای مختلف و کار به عنوان مسئول مکاتبات و مکالمات خارجی شرکت توسعه اطلاعات بوده است .علاوه بر زبان انگلیسی ، آشنایی متوسط با زبان های اسپانیولی و ترکی استانبولی را نیز دارا می باشم .

 

شما اولین نفری باشید که برای این خبر نظر میدهد
تصویر امنیتی



عبارت در تصویر را وارد کنید


کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

در حال حاضر، باکتریِ مقاوم در برابر آنتی بیوتیک (MRSA) در طول سال باعث مرگ هفتصد هزار نفر می شود. دانشمندان نگران این موضوع هستند که این آمار در سال 2050 به رقم هولناک ده میلیون نفر در سال برسد. در این بین دانشجویی 25 ساله از دانشگاه ملبورن بنام خانم «شو لام» باور دارد که راه حل را یافته است. او توانست راهی را کشف کند که مقاومت در برابر آنتی بیوتیک ها در باکتری ها را از بین ببرد و اینکار را بدون استفاده از آنتی بیوتیک ها انجام داده است. وی با موفقیت کامل یک مشکل بزرگ در تست های آزمایشگاهی را با استفاده از یک «پلیمرِ ستاره ای شکل» که باعث شکاف در سلولها می شود، برطرف کرده است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

تصور کنید که ایمپلنتهای استخوانی آینده از ذرات ریزی از گرافن که با هم جوش خورده اند و به ماده ای جامد تبدیل شده اند، ساخته شوند! این مهم بر اساس مطالعه ای که توسط دانشمندان دانشگاه رایس انجام گرفته امکانپذیر است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

تحقیق جدیدی که مسئولیت آنرا دانشمندان کینگ کالج لندن و دانشگاه بریستول برعهده داشتند مشخص کرد که رژیمهای پرچرب و پرقند در طول بارداری با بروز علائم اختلال کم توجهی (ADHD) در کودکان مرتبط است. این مطالعه در ژورنال Child Psychology and Psychiatry منتشر گردیده و اولین مطالعه در نوع خود است که بیان می کند مشکلات رفتاری کودک و همچنین اختلال کم توجهی و بیش فعالی بخاطر تاثیر مستقیم رژیم غذایی ناسالم مادر مخصوصاً در زمان بارداری است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

محققان موفق شدند طی یک درمانِ آزمایشی در موشهای مبتلا به دیابت، رگهای جدیدی را تولید کنند. این درمان در نهایت می تواند به افرادی که به بیماریهای عروقی مبتلا هستند، امیدهای تازه ای بدهد. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه شوید...

مطالعه متن کامل
صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

سویلنت 2 هم صبحانه است، هم نهار و هم شام، آنهم بصورت یک نوشیدنی. «سویلنت کافی اِست» برای تامین کافئین و داشتن طعم شکلات، در خودش کمی قهوه دارد. 20 درصد از آنرا ماکروناترینت تشکیل شده تا مواد مغذی روزانه شما را تامین کند. همچنین با اضافه کردن روغنهای موجود در برگه هلو، عصاره های سویا و آمینو اسیدهای موجود در چای سبز در نهایت معجونی برای صبحانه شما آماده می کند که با انرژی فوق العاده صبح خود را آغاز کنید.

مطالعه متن کامل
داستان همیشگی موبایل و حواس پرتی راننده

داستان همیشگی موبایل و حواس پرتی راننده

شرکت بیمه‌ی State Farm اخیراً با انجام یک نظرسنجی دریافته است در مقایسه با سال 2009، افراد کمتری در حین رانندگی با گوشی موبایل صحبت می‌کنند. با این وجود در همین بازه‌ی زمانی، تعداد افرادی که در حین رانندگی پیام می‌فرستند از 5 درصد به 36 درصد افزایش پیدا کرده است.

مطالعه متن کامل
به روز رسانی آیندهِ Apple Map‌، می‌تواند رفت و آمد روزانه شما را آسانتر کند.

به روز رسانی آیندهِ Apple Map‌، می‌تواند رفت و آمد روزانه شما را آسانتر کند.

زمانی که Apple Map برای اولین بار عرضه شد، یک شکست ننگین و کاملا شرم‌آور بود. از آن زمان، اپل قابلیت های جدیدی اضافه کرده و کیفیت مسیرهای نقشه ها ارتقا داده است، با این وجود، این برنامه هنوز هم چیزی کم دارد. همه کسانی که در شهر های بزرگ زندگی می‌کنند احتمالا از Hopstop، Google Maps، Embark و دیگر برنامه های Third Party استفاده کرده اند، این برنامه ها، تمام اطلاعات موجود درباره مترو، اتوبوس ها و قطارها را به کاربر می‌دهد. اما در حال حاضر به نظر می‌رسد، اپل، بر اساس اختراعی که توسط Patently Apple کشف شده است، می‌خواهد راه حل مختص به خود را برای این مسائل ارائه دهد. نام این اختراع "ابزار رابط مصرف کننده برای کمک به رفت و آمد" است که 4 دسامبر، در اداره ثبت اختراع و ثبت علامت تجاری ایالت متحده (USPTO) ثبت شده است.

مطالعه متن کامل
طرح جدید ناسا برای فرستادن فضانوردان به سیاره زهره

طرح جدید ناسا برای فرستادن فضانوردان به سیاره زهره

برای دهه‌ها پس از رفتن به ماه، رفتن به سیاره مریخ به عنوان قدم بعدی، ذهن زمینی‌ها را به خود مشغول کرده است. اما ناسا در فکر راه‌های فرستادن انسان به یکی دیگر از همسایگان خطرناک خود، یعنی زهره است.

مطالعه متن کامل
دست مکانیکی انقلابی و اضافه سازی حس لامسه به پروتزهای کنترل شونده ذهنی

دست مکانیکی انقلابی و اضافه سازی حس لامسه به پروتزهای کنترل شونده ذهنی

در دست ماژولار یاد شده که توسط دانشگاه جانز هاپکینز ساخته شده است، از فناوری دارپا به منظور ایجاد حس لامسه در کاربر بهره گیری می شود. دست مکانیکی که درساخت آن از فناوری های عصبی ابداعی دارپا استفاده شده است، اولین نمونه در نوع خود محسوب می شود که به بیماران معلول امکان برخورداری از حس لامسه از طریق استفاده ازپروتز را می بخشد. کاربر 28 ساله ای که در تست این وسیله شرکت داشت توانست با چشمان بسته و با دقت تمام «لمس کردن» را تشخیص بدهد.

مطالعه متن کامل
نسخه آندرویدی نقشه های HERE maps به روزرسانی شد

نسخه آندرویدی نقشه های HERE maps به روزرسانی شد

هفته جاری تیم سازنده اپ HERE maps (همان تیم قدیمی نوکیا) اپ خودشان را مستقیما از روی نسخه آزمایشی عرضه شده بروزرسانی کردند. به این ترتیب، این اولین عرضه کامل اپ HERE برای آندروید است و آنطور که معلوم است واقعا هم ارزش استفاده را دارد، تا این لحظه نیز 3 میلیون دانلود از اپ یادشده صورت گرفته است. کاربران می توانند مسیردهی ارتقا یافته، قابلیت های ارتباطی جدید بر روی نقشه ها (نظیر اطلاعات تماس، عکس ها، بررسی، نقشه های محیطی 3 بعدی و "پولیش بصری" جدید که برای تاکید بر اهمیت اپ تعبیه شده) را استفاده کنند.

مطالعه متن کامل