کوی دانش - kooy

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند
29 اردیبهشت
09:45 1395
تصویر فوق: هانک باس استادیار دانشگاه، تکنیکی ژنتیکی را نشان می دهد که وی و دانیل ورا پیشگام استفاده از آن در دانشگاه ایالت فلوریدا بوده اند. محققان FSU و دانشگاه کورنل با استفاده از تکنیک نقشه برداری ژنتیکی که توسعه داده شده است، نشان دادند درصد کوچکی از کل ژنوم ذرت مسئول تمام تنوع صفات این گیاه می باشد. هانک باس، استادیار علوم زیست شناسی در FSU، و دانیلا ورا مدیر یک مرکز پزشکی و ژنومیک FSU از دانش فنی خود در زمینه نقشه برداری از ژنوم ذرت استفاده کرده و آنرا با دانش فنی ژنومیک های آماری همکاران دیگر در دانشگاه کورنل به نام های الی راجرز ملنیک و اد باکلر ترکیب نموده و دریافتند بخش کوچکی از کروماتیک، همان کمپلکس DNA و پروتئین های مربوطه به آن، مسئول 40 درصد از تنوع ارثی صفات ذرت می باشد.


به این ترتیب بخش کوچکی از کروماتین مسئول بخش بزرگی از اطلاعاتی است که ویژگی هایی نظیر اندازه گیاه، شکل، واکنش به استرس و حاصل آنرا مشخص می کند. 
باس ادامه می دهد: "آنچه که در ضمن انجام مطالعه یاد شده باعث تعجب من شد این بود که تکنیک پروفایل بندی کروماتین در نقشه برداری از بخش مهم کاربردی ژنوم ذرت تا چه اندازه موثر می باشد."
تحقیق مزبور در نسخه 16 ماه می ژورنال Proceedings of the National Academy of Sciences منتشر شده است.  
شناسایی این بخش از ژنوم باعث می شود تا حوزه ای که به منظور رشد ذرت و ادیت ژنومیک بررسی می شود بسیار کوچک شود، که همین می تواند سرعت بهبود محصولات کشاورزی را تا حد زیادی ارتقا دهد. بدین ترتیب افرادی که بکار پرورش ذرت می پردازند می توانند نواحی ژنومی را که در توسعه محصولاتی مقاوم تر در برابر خشکسالی یا بادوام در زیست محیط های صعب نقش دارد، به سرعت هدفگیری نمایند. 
باکلر می گوید: "نتیجه آنست که می توانیم تغییرات جفتی تک پایه (جهش های کوچک) تنظیم کننده و یا آنهایی را که به گیاهان امکان تطابق با زیست محیطشان را می دهد هدفگیری نماییم. یعنی می توانیم تلاش های خود را به صورت بسیار تخصصی تر ادامه بدهیم."
ذرت به عنوان «گونه مدل» در تحقیقات علمی شناخته می شود، زیرا تنوع ژنتیکی و منابع استثنایی داشته و دهه ها تحقیق راهگشا در زمینه مکانیسم های وراثتی را تضمین می کند.
 این مطالعه جدید در تشریح نحوه بیان داشتن ژن های مختلف از سوی گیاهان  که در انواع سلولی مختلف صورت می گیرد کمک می کند، لازم به ذکر است که به این منظور DNA بایستی به اندازه تقریبا 1 میلیونیوم طول خود فشرده شود تا داخل هسته سلولی جای بگیرد. حتی در صورت فشرده شدن نیز، باز مناطقی به نام «کروماتینِ باز» وجود دارد که الگوهای پیچیده تنظیم ژنی را هماهنگ می سازد. محققان می خواستند ببینند در فضای «کروماتین باز» چه اتفاقی می افتد. 
مطالعه مزبور نشان دهنده اولین مورد استفاده از تکنیک پروفایل بندی کروماتین است که ورا و باس به عنوان بخشی از پروژه ای که هزینه آن توسط NSF تامین شده، در دانشگاه دولتی فلوریدا توسعه دادند. به این منظور محققان دانشگاه کورنل 600 هسته را به FSU فرستادند تا ورا و باس آنها را کشت کرده و به نهال بدل شد، بافت را از ریشه ها، ساقه و برگ ها جمع آوری نمودند و سپس هسته سلول را جداسازی نمودند. هسته در معرض آنزیمی قرار گرفت که بخش های خاصی از DNA را می بُرد و داده ها به صورت محاسباتی و آماری تحلیل شدند تا بتوان کروماتین باز را در ژنوم شناسایی نمود.
 به گفته باس: "مثل پیدا کردن کلید برق روی دیوار می ماند. پروفایل بندی کروماتین نشان می دهد که کدام بخش از ژنوم، نقش کلید برق ژنتیکی را به عهده دارد."

کلمات کلیدی

اشتراک

درباره نویسنده

هنگامه خوش خلق

هنگامه خوش خلق

اینجانب فعالیت خود را به عنوان مترجم از سال 88 و با همکاری با انتشارات طاهریان آغاز کردم .و سپس به عنوان کارمند مترجم با شرکت های مختلفی همکاری داشته ام . در این میان لازم به ذکر است که فعالیت های اینجانب علاوه بر ترجمه کتاب (در آخرین مورد نشر آوند دانش)شامل ترجمه مقالات ، همکاری به عنوان مترجم شفاهی در دوره ها و سمینارهای مختلف و کار به عنوان مسئول مکاتبات و مکالمات خارجی شرکت توسعه اطلاعات بوده است .علاوه بر زبان انگلیسی ، آشنایی متوسط با زبان های اسپانیولی و ترکی استانبولی را نیز دارا می باشم .

 

شما اولین نفری باشید که برای این خبر نظر میدهد
تصویر امنیتی



عبارت در تصویر را وارد کنید


کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

در حال حاضر، باکتریِ مقاوم در برابر آنتی بیوتیک (MRSA) در طول سال باعث مرگ هفتصد هزار نفر می شود. دانشمندان نگران این موضوع هستند که این آمار در سال 2050 به رقم هولناک ده میلیون نفر در سال برسد. در این بین دانشجویی 25 ساله از دانشگاه ملبورن بنام خانم «شو لام» باور دارد که راه حل را یافته است. او توانست راهی را کشف کند که مقاومت در برابر آنتی بیوتیک ها در باکتری ها را از بین ببرد و اینکار را بدون استفاده از آنتی بیوتیک ها انجام داده است. وی با موفقیت کامل یک مشکل بزرگ در تست های آزمایشگاهی را با استفاده از یک «پلیمرِ ستاره ای شکل» که باعث شکاف در سلولها می شود، برطرف کرده است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

تصور کنید که ایمپلنتهای استخوانی آینده از ذرات ریزی از گرافن که با هم جوش خورده اند و به ماده ای جامد تبدیل شده اند، ساخته شوند! این مهم بر اساس مطالعه ای که توسط دانشمندان دانشگاه رایس انجام گرفته امکانپذیر است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

تحقیق جدیدی که مسئولیت آنرا دانشمندان کینگ کالج لندن و دانشگاه بریستول برعهده داشتند مشخص کرد که رژیمهای پرچرب و پرقند در طول بارداری با بروز علائم اختلال کم توجهی (ADHD) در کودکان مرتبط است. این مطالعه در ژورنال Child Psychology and Psychiatry منتشر گردیده و اولین مطالعه در نوع خود است که بیان می کند مشکلات رفتاری کودک و همچنین اختلال کم توجهی و بیش فعالی بخاطر تاثیر مستقیم رژیم غذایی ناسالم مادر مخصوصاً در زمان بارداری است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

محققان موفق شدند طی یک درمانِ آزمایشی در موشهای مبتلا به دیابت، رگهای جدیدی را تولید کنند. این درمان در نهایت می تواند به افرادی که به بیماریهای عروقی مبتلا هستند، امیدهای تازه ای بدهد. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه شوید...

مطالعه متن کامل
صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

سویلنت 2 هم صبحانه است، هم نهار و هم شام، آنهم بصورت یک نوشیدنی. «سویلنت کافی اِست» برای تامین کافئین و داشتن طعم شکلات، در خودش کمی قهوه دارد. 20 درصد از آنرا ماکروناترینت تشکیل شده تا مواد مغذی روزانه شما را تامین کند. همچنین با اضافه کردن روغنهای موجود در برگه هلو، عصاره های سویا و آمینو اسیدهای موجود در چای سبز در نهایت معجونی برای صبحانه شما آماده می کند که با انرژی فوق العاده صبح خود را آغاز کنید.

مطالعه متن کامل
شرکت معماری روتی، خانه مسکونی دو طبقه ای را در زمینی شیب دار در ژاپن طراحی کرده است

شرکت معماری روتی، خانه مسکونی دو طبقه ای را در زمینی شیب دار در ژاپن طراحی کرده است

شرکت معماری روتی آرشیتکتس، خانه ای مسکونی با نمای تمام چوبی را در زمینی شیب دار در شهر فوکواوکای ژاپن طراحی و ساخته است. بین دو قسمت مجزای این خانه که N house" نامیده شده است، به لحاظ ارتفاع 4 متر اختلاف وجود دارد و عرض آن 16 متر است، سعی شده تا از تمامی ابعاد زمین در دسترس استفاده شود.

مطالعه متن کامل
تهیه نقشه توزیع خزه های دریایی در زیر یخ های دریای شمالگان توسط یک ربات زیرآبی کاملا "خود هدایت شونده"

تهیه نقشه توزیع خزه های دریایی در زیر یخ های دریای شمالگان توسط یک ربات زیرآبی کاملا "خود هدایت شونده"

هرسال اوایل بهار در شمالگان و زیر یخ های دریایی پوشش های خزه تشکیل می شود. این توده ها (به همراه باکتری هایی که داخلشان زندگی می کنند) منبع غذای زوپلانکتون ها هستند که اساسا زنجیره غذای سالیانه از آنها نشأت می گیرد. با توجه به چنین نقش مهم اکولوژیکی که این خزه های دریایی بازی می کنند، دانشمندان دانشگاه آرهوسِ دانمارک تصمیم به بررسی بهتر توزیع خزه ها گرفتند. به همین منظور، از یک وسیله بی سرنشینِ های-تک زیرآبی استفاده می کنند.

مطالعه متن کامل
فضاپیمای کپلر ناسا موفق به کشف 1284 اگزوپلنت جدید شده است

فضاپیمای کپلر ناسا موفق به کشف 1284 اگزوپلنت جدید شده است

با توجه به کشف بیش از هزار سیاره جدید که در حال چرخش به دور ستاره های دوردست هستند، آنهم توسط فضاپیمای کپلر ناسا، جهانی که می شناختیم بسیار بزرگتر از قبل شده است. در جولای سال 2015 تلسکوپ فضایی یاد شده موفق به شناسایی 4302 اگزوپلنت بالقوه شد، و تحلیل های بیشتر هم نشان داد تعداد 1284 عدد از این کاندیدها تا 99% به واقع سیاره هستند. 1327 جرم کشف شده دیگر نیز احتمالا سیاره باشد، اما تثبیت این امر محتاج مطالعه بیشتر و سپس طبقه بندی کردنشان است. مطالعه مزبور به علاوه 984 سیاره دیگری را کشف کرده است که با استفاده از تکنیک های دیگر شناسایی شده اند.

مطالعه متن کامل
ویدئوهای تبلیغی جدید اچ تی سی وان ام 9، ویژگی های این پرچمدار جدید را به نمایش کشیده است

ویدئوهای تبلیغی جدید اچ تی سی وان ام 9، ویژگی های این پرچمدار جدید را به نمایش کشیده است

شرکت اچ تی سی به خوبی واقف است که از نظر بازاریابی مدل های پرچمدار خود عملکرد زیاد جالبی نداشته است. با این وجود، به تازگی 5 ویدئوی تبلیغی از سوی همین شرکت برای اچ تی سی وان ام 9 منتشر شده است که در حقیقت قلب این تلفن را هدف گرفته اند و ویژگی های این گوشی هوشمند را به تصویر می کشند.

مطالعه متن کامل
پوششی تغییر شکل پذیر، برای محافظت از نوسانات حرارتیِ یک مرکز پزشکی

پوششی تغییر شکل پذیر، برای محافظت از نوسانات حرارتیِ یک مرکز پزشکی

یک مرکز پزشکی غیر عادی که برای العین، چهارمین شهر بزرگ امارات متحده عربی برنامه ریزی شده است شامل برج بزرگی است که در پوششی تغییر شکل پذیر پیچیده شده است. این پوشش عجیب کمک می کند تا نوسانات حرارتی شدید این منطقه متوازن شود. شرکت معماری Philippe Barriere Collective (PB+Co) دست به طراحی این پروژه به عنوان ترکیب مدرنی از پزشکی غربی و آلترناتیو، شیوه های حفظ محیط طبیعی و فناوری زده اند.

مطالعه متن کامل