کوی دانش - kooy

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند

تیم دانشگاه کورنل و FSU، بخش معنادار ژنوم ذرت را تعریف کردند
29 اردیبهشت
09:45 1395
تصویر فوق: هانک باس استادیار دانشگاه، تکنیکی ژنتیکی را نشان می دهد که وی و دانیل ورا پیشگام استفاده از آن در دانشگاه ایالت فلوریدا بوده اند. محققان FSU و دانشگاه کورنل با استفاده از تکنیک نقشه برداری ژنتیکی که توسعه داده شده است، نشان دادند درصد کوچکی از کل ژنوم ذرت مسئول تمام تنوع صفات این گیاه می باشد. هانک باس، استادیار علوم زیست شناسی در FSU، و دانیلا ورا مدیر یک مرکز پزشکی و ژنومیک FSU از دانش فنی خود در زمینه نقشه برداری از ژنوم ذرت استفاده کرده و آنرا با دانش فنی ژنومیک های آماری همکاران دیگر در دانشگاه کورنل به نام های الی راجرز ملنیک و اد باکلر ترکیب نموده و دریافتند بخش کوچکی از کروماتیک، همان کمپلکس DNA و پروتئین های مربوطه به آن، مسئول 40 درصد از تنوع ارثی صفات ذرت می باشد.


به این ترتیب بخش کوچکی از کروماتین مسئول بخش بزرگی از اطلاعاتی است که ویژگی هایی نظیر اندازه گیاه، شکل، واکنش به استرس و حاصل آنرا مشخص می کند. 
باس ادامه می دهد: "آنچه که در ضمن انجام مطالعه یاد شده باعث تعجب من شد این بود که تکنیک پروفایل بندی کروماتین در نقشه برداری از بخش مهم کاربردی ژنوم ذرت تا چه اندازه موثر می باشد."
تحقیق مزبور در نسخه 16 ماه می ژورنال Proceedings of the National Academy of Sciences منتشر شده است.  
شناسایی این بخش از ژنوم باعث می شود تا حوزه ای که به منظور رشد ذرت و ادیت ژنومیک بررسی می شود بسیار کوچک شود، که همین می تواند سرعت بهبود محصولات کشاورزی را تا حد زیادی ارتقا دهد. بدین ترتیب افرادی که بکار پرورش ذرت می پردازند می توانند نواحی ژنومی را که در توسعه محصولاتی مقاوم تر در برابر خشکسالی یا بادوام در زیست محیط های صعب نقش دارد، به سرعت هدفگیری نمایند. 
باکلر می گوید: "نتیجه آنست که می توانیم تغییرات جفتی تک پایه (جهش های کوچک) تنظیم کننده و یا آنهایی را که به گیاهان امکان تطابق با زیست محیطشان را می دهد هدفگیری نماییم. یعنی می توانیم تلاش های خود را به صورت بسیار تخصصی تر ادامه بدهیم."
ذرت به عنوان «گونه مدل» در تحقیقات علمی شناخته می شود، زیرا تنوع ژنتیکی و منابع استثنایی داشته و دهه ها تحقیق راهگشا در زمینه مکانیسم های وراثتی را تضمین می کند.
 این مطالعه جدید در تشریح نحوه بیان داشتن ژن های مختلف از سوی گیاهان  که در انواع سلولی مختلف صورت می گیرد کمک می کند، لازم به ذکر است که به این منظور DNA بایستی به اندازه تقریبا 1 میلیونیوم طول خود فشرده شود تا داخل هسته سلولی جای بگیرد. حتی در صورت فشرده شدن نیز، باز مناطقی به نام «کروماتینِ باز» وجود دارد که الگوهای پیچیده تنظیم ژنی را هماهنگ می سازد. محققان می خواستند ببینند در فضای «کروماتین باز» چه اتفاقی می افتد. 
مطالعه مزبور نشان دهنده اولین مورد استفاده از تکنیک پروفایل بندی کروماتین است که ورا و باس به عنوان بخشی از پروژه ای که هزینه آن توسط NSF تامین شده، در دانشگاه دولتی فلوریدا توسعه دادند. به این منظور محققان دانشگاه کورنل 600 هسته را به FSU فرستادند تا ورا و باس آنها را کشت کرده و به نهال بدل شد، بافت را از ریشه ها، ساقه و برگ ها جمع آوری نمودند و سپس هسته سلول را جداسازی نمودند. هسته در معرض آنزیمی قرار گرفت که بخش های خاصی از DNA را می بُرد و داده ها به صورت محاسباتی و آماری تحلیل شدند تا بتوان کروماتین باز را در ژنوم شناسایی نمود.
 به گفته باس: "مثل پیدا کردن کلید برق روی دیوار می ماند. پروفایل بندی کروماتین نشان می دهد که کدام بخش از ژنوم، نقش کلید برق ژنتیکی را به عهده دارد."

کلمات کلیدی

اشتراک

درباره نویسنده

هنگامه خوش خلق

هنگامه خوش خلق

اینجانب فعالیت خود را به عنوان مترجم از سال 88 و با همکاری با انتشارات طاهریان آغاز کردم .و سپس به عنوان کارمند مترجم با شرکت های مختلفی همکاری داشته ام . در این میان لازم به ذکر است که فعالیت های اینجانب علاوه بر ترجمه کتاب (در آخرین مورد نشر آوند دانش)شامل ترجمه مقالات ، همکاری به عنوان مترجم شفاهی در دوره ها و سمینارهای مختلف و کار به عنوان مسئول مکاتبات و مکالمات خارجی شرکت توسعه اطلاعات بوده است .علاوه بر زبان انگلیسی ، آشنایی متوسط با زبان های اسپانیولی و ترکی استانبولی را نیز دارا می باشم .

 

شما اولین نفری باشید که برای این خبر نظر میدهد
تصویر امنیتی



عبارت در تصویر را وارد کنید


کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

کشف راهی برای حذف مقاومت در برابر آنتی بیوتیک در باکتری ها

در حال حاضر، باکتریِ مقاوم در برابر آنتی بیوتیک (MRSA) در طول سال باعث مرگ هفتصد هزار نفر می شود. دانشمندان نگران این موضوع هستند که این آمار در سال 2050 به رقم هولناک ده میلیون نفر در سال برسد. در این بین دانشجویی 25 ساله از دانشگاه ملبورن بنام خانم «شو لام» باور دارد که راه حل را یافته است. او توانست راهی را کشف کند که مقاومت در برابر آنتی بیوتیک ها در باکتری ها را از بین ببرد و اینکار را بدون استفاده از آنتی بیوتیک ها انجام داده است. وی با موفقیت کامل یک مشکل بزرگ در تست های آزمایشگاهی را با استفاده از یک «پلیمرِ ستاره ای شکل» که باعث شکاف در سلولها می شود، برطرف کرده است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

گرافن سه بعدی با کاربردهای زیستی

تصور کنید که ایمپلنتهای استخوانی آینده از ذرات ریزی از گرافن که با هم جوش خورده اند و به ماده ای جامد تبدیل شده اند، ساخته شوند! این مهم بر اساس مطالعه ای که توسط دانشمندان دانشگاه رایس انجام گرفته امکانپذیر است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

خطر رژیمهای غذایی ناسالم در طول بارداری بر جنین

تحقیق جدیدی که مسئولیت آنرا دانشمندان کینگ کالج لندن و دانشگاه بریستول برعهده داشتند مشخص کرد که رژیمهای پرچرب و پرقند در طول بارداری با بروز علائم اختلال کم توجهی (ADHD) در کودکان مرتبط است. این مطالعه در ژورنال Child Psychology and Psychiatry منتشر گردیده و اولین مطالعه در نوع خود است که بیان می کند مشکلات رفتاری کودک و همچنین اختلال کم توجهی و بیش فعالی بخاطر تاثیر مستقیم رژیم غذایی ناسالم مادر مخصوصاً در زمان بارداری است. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه باشید...

مطالعه متن کامل
ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

ساخت رگهای خونی جدید با یک ژل تزریقی

محققان موفق شدند طی یک درمانِ آزمایشی در موشهای مبتلا به دیابت، رگهای جدیدی را تولید کنند. این درمان در نهایت می تواند به افرادی که به بیماریهای عروقی مبتلا هستند، امیدهای تازه ای بدهد. برای بررسی بیشتر با کوی دانش همراه شوید...

مطالعه متن کامل
صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

صبحانه، نهار وشام در یک بطری!

سویلنت 2 هم صبحانه است، هم نهار و هم شام، آنهم بصورت یک نوشیدنی. «سویلنت کافی اِست» برای تامین کافئین و داشتن طعم شکلات، در خودش کمی قهوه دارد. 20 درصد از آنرا ماکروناترینت تشکیل شده تا مواد مغذی روزانه شما را تامین کند. همچنین با اضافه کردن روغنهای موجود در برگه هلو، عصاره های سویا و آمینو اسیدهای موجود در چای سبز در نهایت معجونی برای صبحانه شما آماده می کند که با انرژی فوق العاده صبح خود را آغاز کنید.

مطالعه متن کامل
پیله مدور را می توان از درختان آویخت یا با هر مکانی تطابق داد

پیله مدور را می توان از درختان آویخت یا با هر مکانی تطابق داد

"درخت پیله ای" که تنها 60 کیلوگرم وزن دارد، پناهگاهی متنوع و مدوراست که حاصل بازتفسیر مفهوم خانه های درختی می باشد. این خانه مقاوم که با چند تشک مفروش شده است، اسکلتی از آلومینیوم داشته و برزنت ضدآب نیز برای پوشش آن به کار رفته است، همچنین 6 کابل دارد که برای حفظ تعلیق آن به کار گرفته شده اند و شش کابل دیگر نیز برای ثابت جانبی تعبیه شده است.

مطالعه متن کامل
نکته سلامتی: مزایای اکسیژن تراپی

نکته سلامتی: مزایای اکسیژن تراپی

اکسیژن تراپی، برای شما اکسیژن کافی و گاها بیش از حد فراهم می کند. این نوع درمان با توجه به شرایط آلودگی هوایی که در شهرهای بزرگ با آن دست و پنجه نرم می کنیم و بیماریهایی که در این زمانه با آن روبرو هستیم می تواند بسیار مفید باشد. در ادامه سه ویژگیِ اکسیژن تراپی را برای شما آورده ایم. با کوی دانش همراه شوید...

مطالعه متن کامل
چگونه ظاهرِ گوشی غیر سونیِ خود را با استفاده از نرم‌افزار شبیه به Xperia کنیم؟

چگونه ظاهرِ گوشی غیر سونیِ خود را با استفاده از نرم‌افزار شبیه به Xperia کنیم؟

اگر به ظاهرِ UI ِ سونی که در گوشی‌های Xperia از آن استفاده می‌شود، علاقه‌مند شده‌اید اما گوشی شما Xperia نیست، می‌توانید گوشی‌ هوشمندِ اندروید سونی خود را به آن شبیه سازید.

مطالعه متن کامل
ساعت مچی هوشمند ویتینگز اکتیو Withings  Active مشوق سبک زندگی سالم و تناسب اندام

ساعت مچی هوشمند ویتینگز اکتیو Withings Active مشوق سبک زندگی سالم و تناسب اندام

ساعت مچی هوشمند Withings Active با نظارت بر فعالیت ها و خواب، مشوق افراد برای داشتن اندامی متناسب است

مطالعه متن کامل
نقش تغییرات ژنتیکی در پیشرفت سرطان پوست مشخص شد

نقش تغییرات ژنتیکی در پیشرفت سرطان پوست مشخص شد

سرطان سلول های فلسی (SCC) پوست یکی از شایع ترین انواع سرطان است که هر ساله بیش از نیم میلیون نفر در جهان به آن مبتلا می شوند. تبدیل سلول های طبیعی به سلول های سرطانی به دلیل تجمع اختلالات ژنتیکی در سلول های حاصل از تقسیم هر سلول است. طیفِ ناهنجاری های ژنتیکی یافت شده در انواع سرطان ها در انسان، قبلاً توصیف شده است. سرطان سلول های فلسی که در اندام های مختلف مانند سر و گردن، شش ها، مری و پوست بروز می کند، ناشی از عوامل سرطان زایی همچون مصرف دخانیات و قرار گرفتن در معرض تابش اشعه UV است. از یک قرن پیش تا کنون، موش های آزمایشگاهی مبتلا به SCC پوستی ناشی از تحمیل مواد سرطان زا، رایج ترین نمونه ها برای مطالعه سرطان در بدن بودند. اما این موضوع که آیا SCC پوست ناشی از تحمیل مواد سرطان زا در موش ها، بوسیله همان طیف جهش ژنی سرطان در انسان گسترش می یابد یا خیر، هنوز مشخص نیست.

مطالعه متن کامل